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En el año 2018, debido a la superpoblacion de la Tierra, la humanidad se ve obligada a colonizar los mares, creando la Organizacion de Oceanos de la Tierra Unida (UEO), entidad militar encargada de mantener el orden. La UEO convence a Nathan Bridger, un oficial retirado desde la muerte de su esposa y dedicado al estudio de los delfines, para volver al servicio activo al mando del Seaquest DSV, un poderoso submarino con el que debera patrullar el fondo del mar y velar por la paz de los oceanos. La tripulacion de este submarino esta integrada por personal militar y cientifico. Entre sus miembros encontramos a un adolescente prodigio graduado cum laude en inteligencia artificial por la Universidad de Stanford, y hasta un delfin parlante.