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Serie de TV (2004-2009). 5 temporadas. 100 episodios. La historia de la serie parte del final de la septima temporada y el inicio de la octava de Stargate SG-1. Un grupo de cientificos, entre los que se encuentran el Dr. Daniel Jackson, la Doctora Elizabeth Weir y el Dr. Rodney McKay, estan estudiando el puesto avanzado de los Antiguos que O'Neill descubrio al final de la septima temporada. El Dr. Jackson consigue averiguar que paso con Atlantis: los Antiguos se la llevaron a otra galaxia, Pegaso, y tiene la direccion de donde fueron. El problema es que abrir el Stargate a otra galaxia gasta mucha energia, por lo que es posible que sea un viaje sin retorno. Sin embargo, una expedicion cientifico-militar, la Expedicion Atlantis, capitaneada por la propia Weir, decide embancarse en la aventura y parte hacia la ciudad perdida de los Antiguos, Atlantis.
Una vez alli, se encontraran con un enemigo mucho peor que los Goaul'd; los Wraith (Espectros), una raza que se alimenta de la energia vital de los seres humanos y que, 10.000 años atras, obligaron a los Antiguos a abandonar Pegaso y volver a la Tierra.
Stargate Atlantis es una serie de ciencia-ficcion basada en la serie Stargate SG-1 que se estreno el 16 de julio de 2004 en el Sci-Fi channel americano. Pensada en un principio para suceder a Stargate SG-1, cuando este fue renovada por una nueva temporada, la accion de Stargate Atlantis se traslado a la galaxia de Pegaso. La serie fue un exito instantaneo, superando incluso, en ocasion, a su predecesora.